Genética: probabilidade de herdar doença autossômica dominante

Antes de ver o exemplo, convém ler, neste mesmo blog, as postagens:
 Teorema de Bayes 
Testes diagnósticos: sensibilidade e especificidade .

Considere
a porfiria, uma doença autossômica dominante. Toda pessoa afetada tem um genitor afetado e tem 50% de
chance de transmitir o gene (e consequentemente a doença) para os filhos.
Veja
o heredograma, em que verde indica pessoa sem a doença e vermelho indica pessoa afetada.
 

Existe
um teste para o diagnóstico precoce da doença, que tem sensibilidade  0,82 e especificidade é 0,963.

Situação
1
:
Uma
pessoa teve resultado positivo no teste para a porfiria. Qual é a probabilidade
de essa pessoa ter a doença?
Sem qualquer
informação adicional
, a resposta é óbvia: se a sensibilidade do
teste (probabilidade de verdadeiros positivos no total de doentes) é 0,82, a
probabilidade de essa pessoa ter porfiria é 0,82 ou 82%.

Situação 2: A
porfiria é uma doença rara, que ocorre na população com probabilidade 0,01%. Se
uma pessoa tomada ao acaso da população obtiver resultado positivo no teste
para a doença, qual é a probabilidade de ela ter a doença?


Como a sensibilidade do teste é 0,82 e a
especificidade é 0,963, a probabilidade de a pessoa, que teve resultado positivo
no teste diagnóstico ter a doença deve ser obtida pelo teorema de Bayes. Veja o diagrama de árvore. Observando o diagrama, fica mais fácil calcular a probabilidade de a pessoa ter porfiria, dado que o teste positivou.



Situação 3: A
porfiria é uma doença autossômica dominante. É
 dada a informação
adicional de que uma pessoa que fez o
teste tem um irmão germano com porfiria.
Se o resultado  no teste foi positivo, qual é a probabilidade de essa pessoa ter a
doença?
A probabilidade de um paciente que tem irmão com a
doença ter porfiria se tiver resultado positivo no teste é obtida pelo teorema
de Bayes. Observe o diagrama de árvore e calcule a probabilidade pedida.


Situação 4: Uma pessoa  não conhece seu histórico genético familiar (digamos foi adotada
bebê), mas um médico experiente tem o palpite de que a  probabilidade de essa pessoa ter a porfíria é 30%. Se a pessoa positivar no teste, qual é a probabilidade de essa pessoa ter
porfiria?
 
A probabilidade é obtida aplicando o teorema de Bayes. Veja o diagrama de árvore e o cálculo abaixo.

Pense nisto: para a mesma pergunta – qual é a probabilidade de a
pessoa ter a doença? – foram obtidas respostas  diferentes. Por quê?



O teorema de Bayes permite rever um valor calculado de probabilidade com base em informação
anterior.
Qual das respostas é a
correta? Depende da situação:



v  Na
1ª situação, a probabilidade de a pessoa ter a doença foi obtida apenas pela
sensibilidade do teste.
v  Na 2ª
situação, a probabilidade foi obtida considerando a baixa prevalência na
população, conhecida por grandes levantamentos (surveys) feitos anteriormente.
v  Na 3ª
situação, a probabilidade a priori foi obtida considerando, em seu cálculo,
conhecimento de genética e a história familiar do paciente.

v  Na 4ª
situação, a probabilidade foi obtida levando em conta o palpite (educated guess) do médico, ou seja, a
partir de intuição clínica.

                                   IMPORTANTE
O teorema de Bayes permite incorporar conhecimentos
anteriores aos fatos observados: usamos um valor de probabilidade a priori (obtida antes de saber o resultado do teste)
para mais bem estimar uma probabilidade a
posteriori
, obtida dos dados observados. 



Este exemplo é de 
Motulsky, H. Intuitive Biostatistics.Oxford universityPress. 1995. P133-6.





























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